Nature: 最流行的科学博客

Nature 442, 9(6 July 2006) | doi:10.1038/442009a; Published online 5 July 2006 Nature援引Technorati,于正刊报道了排名所有Blog前3500的科学家Blog。 179th http://scienceblogs.com/pharyngula 1,647th http://www.pandasthumb.org 1,884th http://www.realclimate.org 2,174th http://cosmicvariance.com 3,429th http://scienceblogs.com/scientificactivist 这些Blog的具体介绍,请访问Nature。

科研需要钱来堆

最新一期Science上发表了文章《Metagenomic Analysis of the Human Distal Gut Microbiome》,文章采样两个健康人体排泄物内的细菌,进行了相当于environmental环境测序的研究。如下面引用,他们一共获取了接近140,000(十四万)高质量测序读取结果,获取了接近80,000,000bp(八千万碱基对)的序列,平均每个read有570bp。相当于仅仅是高质量的测序反应,就有至少十四万个。如果一次测序成本为3美元,单就测序反应成本就有四十多万美元以上,如果有一半的反应是低质量的测序结果,成本随即提高一倍。 A total of 65,059 and 74,462 high-quality sequence reads were generated from random DNA libraries created with fecal specimens of two healthy humans (subjects 7 and 8). These two subjects, ages 28 and 37, female and male, respectively, had not used antibiotics or any other medications during… Continue reading 科研需要钱来堆

金山词霸可以用来学英语?

刚才上了一下金山词霸在线辞典的网站,看到有一个每日一句,说的是“I am broke.”后面接着的翻译是“我身无分文。” 这样的翻译不仅不地道,更是不准确的。I am broke虽然不是说我已经破产,但是并非等同于我身无分文。美国人常常在别人邀请你出去玩,但是你没有足够的钱来afford这个开支的时候说I am broke。总之,是没有足够的钱来afford一样东西、一件事情的时候,说I am broke。但是此时身上并非绝对没有钱,只是消费不起而已。中文“我身无分文”则是直接的没有一分钱。我身上常常也不带钱,那么我是不是随时都可以说,I am broke呢? 金山词霸,可以用来学英语吗?

New Building in VaTech to be Named Latham Hall

William and Elizabeth Latham decided to give $5 million to Virginia Tech to support research in agricultural and life sciences. The Board of Visitors at Virginia Tech decided to name the new building which our lab is moving to as the William C. and Elizabeth H. Latham Agriculture and Natural Resources Building. Although this building… Continue reading New Building in VaTech to be Named Latham Hall

看到牛人才会感觉到差距才会奋斗

昨天去听了一个UC Berkeley来的Associate Prof.的Seminar,内容相当精彩和有启发性。 他们的思路其实不复杂却很少有人这样去想,而且需要有人手和有很专业的技能的人来实现。这也是为什么国内生物水平那么低的原因啊。国内不仅没有思路,也没有人才。 这位教授口齿伶俐,思路清晰,说话速度非常之快,确实可以感觉到他对自己的领域了如指掌,并且大脑运行速度非常之块,确实让我倍感压力和差距。 但是话说回来,看到牛人才会感觉到差距才会奋斗。

对生命,宇宙和一切的答案是42

Google计算器是这样认为的。 银河系漫游指南是这样说的。 现在连一个不知道是谁的科学家也是这样说的。 为什么是42?没有看懂。随便理解一下,似乎是质数是数学里面最神秘的数字。有两个科学家作出了一个公式来预测质数;按理说质数看起来是完全随机没有规律的;这个公式似乎又可以给出一个怎么样的数字序列。这个序列的前三个数字是:1, 2, 42。

今天的PCR很漂漂

522 今天我的LA PCR很漂漂。从来没有发过PCR发一个来玩玩! 看来还是可以用一般的TAKARA,就不用Hotstart了,太浪费钱了。

一身猪的味道过22岁生日

一个下午都在教本科生解剖猪。那些都是用防腐剂保存的接近出生的猪。恩……现在我觉得我一身都是猪的味道了!不过为了庆祝22岁生日,在学校里面一家店子买了一块pizza,一碗spaghetti,花掉接近9美元,奢侈一把。哪个spaghetti里面的cheeze哪个丝拉的才是小资。可惜味道淡了点,桌子上居然没有盐,吃多了颇有要吐的感觉。反正是吃不玩的,够两个人吃了。吃完之后呢,去研究生生活中心一家店里面喝杯咖啡吧。说来我还没有在美国单独喝过咖啡呢。本来说去星巴克,可惜哪个地方前不着村后不着店的,一直都没有去。想想花了9块钱吃晚饭,咖啡就来杯简单的normal的吧……说拿中杯也是好大一杯…… 喝着咖啡,就来写blog。写完blog,还要去实验室跑我10小时的PCR。就等着回家去洗掉我的猪味了!

第一次真的当老师了。

说实话,我觉得自己也不比这些本科生强。我不也就是本科才毕业吗?出来真的对人是一种锻炼。从开始申请到现在,以及在未来,都是锻炼,都是在国内无法接受到的锻炼。所以从这方面看来,国内现在流行看不起海龟。但是一个真的海龟,确实是经受了呆在国内的人无法理解的锻炼的。海龟的水平,不管怎么说,也应该是有一个基础在那里(锻炼出来的)。 第一节课是很失败的。课堂的秩序没有很好的维持。不是纪律,是秩序。同时个人也没有能够把实验怎么做说得很清楚,导致不少学生犯了错误。第二节课就好多了。第一节课将一些文字知识也是把我折腾得。 教学还是一个很有趣的事情,明天去看看Native speaker的课的状况,然后总结自己的缺陷,以及学生方面的问题。

今天做线虫!从土壤里面提取大量线虫!

Nematode. 我们学植物病理的,当然就是多学科交叉的。虽然我做的研究和线虫倒是没有什么关系,但是长远来看,细菌、真菌、病毒、线虫这些都是要学的。好处还是有的。这样知识面可能还是比较全。 我们使用一种机器在土壤里面把线虫洗出来,沉淀出来,再用蔗糖溶液离心让它们浮出来。土壤里面是有很多线虫的,线虫带来的植物病害所造成的损失是很可怕的。美国70年代以前,完全没有意识到线虫的危害。之后对线虫的研究才被重视起来。而且研究动物发育当然也是有用线虫作为模式生物。我们本周要做5片标本。汗……